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酶是生物體非常重要的一類(lèi)蛋白質(zhì),今天給大家介紹一款特色的DNA外切酶,以去除Fosmid等文庫純化過(guò)程中細菌基因組DNA的污染,一起來(lái)了解下吧~
在質(zhì)粒,粘粒和BAC克隆載體等載體DNA的制備過(guò)程中,使用堿裂解法會(huì )產(chǎn)生細菌染色體DNA片段的污染。如果使用某些方法沒(méi)有有效的去除污染DNA,那么污染的DNA會(huì )連接入克隆載體導致假陽(yáng)性,高背景或錯誤的測序結果。實(shí)驗室常規方法,如純化柱或氯化銫離心不能有效的去除這些污染,因此還需要進(jìn)一步的純化。而Plasmid-Safe™ ATP-Dependent DNase可以選擇性的去除質(zhì)粒,粘粒和BAC克隆載體制備中污染的細菌染色體DNA(圖1)。因此,Plasmid-Safe™ ATP-Dependent DNase是純化質(zhì)粒,粘粒和BAC克隆載體的理想選擇。
1.在大規模質(zhì)粒,粘粒和BAC克隆載體制備中去除污染的細菌染色體DNA
2.消化線(xiàn)性DNA而不消化帶切口或閉環(huán)的dsDNA或超螺旋DNA(質(zhì)粒,fosmid等)
3.用作質(zhì)粒,粘粒,fosmid,BAC載體和克隆制備物的最終純化步驟
4.保護環(huán)狀dsDNA

泳道2:500ng的未被切割的質(zhì)粒DNA;
泳道4:Plasmid-Safe™ DNase處理后的染色體DNA和質(zhì)粒DNA混合物;

△圖2.消除產(chǎn)生白色菌落的線(xiàn)性DNA
3ug的EcoR I消化的細菌基因組DNA中加入2ug含有lacZ的超螺旋質(zhì)粒載體。取一半混合物用Plasmid-Safe™ DNase處理;另一半不處理,作為對照。待Plasmid-Safe™ DNase熱滅活后,將DNA用EcoR I處理,然后用T4DNA連接酶連接過(guò)夜,并轉化到感受態(tài)細胞中,鋪至含有IPTG/X-gal培養基上。用Plasmid-SafeDNase處理的DNA,只有1-3%菌落呈白色,而對照DNA白色菌落數大于50%。利用Plasmid-Safe™ DNase能消除幾乎所有的線(xiàn)性DNA。
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產(chǎn)品名稱(chēng) |
規格 |
貨號 |
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Plasmid-Safe™ ATP-Dependent DNase |
1,000 U @ 10 U/ul |
E3101K |
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Plasmid-Safe™ ATP-Dependent DNase |
1,0000 U @ 10 U/ul |
E3110K |
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